La misión de la Escuela es formar historiadores e historiadoras con pensamiento crítico, capaces de analizar procesos históricos complejos, sin perder de vista los desafíos actuales de nuestras sociedades. Desde sus orígenes, su propuesta formativa ha incorporado enfoques teóricos y metodológicos renovados, con énfasis en el rol público de la disciplina histórica, el uso riguroso de fuentes y el diálogo permanente con las ciencias sociales y las humanidades.
El proyecto intelectual de la Escuela de Historia se articula en torno a tres ejes centrales: una investigación historiográfica metodológicamente sólida; la enseñanza de procesos históricos comparados y globales; y el desarrollo de habilidades de comunicación académica, necesarias en cualquier contexto laboral. Las líneas formativas combinan cursos de historia de Chile, historia de América Latina e historia global, junto con formación en teoría historiográfica y métodos de investigación. Un rasgo distintivo de la Escuela de Historia de la UDP es la incorporación temprana de estudiantes al oficio historiográfico mediante proyectos de archivo, seminarios de investigación y prácticas electivas.